序列数据库和序列比对工具 - 智学轩城

序列数据库和序列比对工具

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宫孟琪

2026-05-12 15:45:34

序列数据库:

  • GenBank:2023年1月,包含超过30亿条序列。
    序列比对工具:
  • BLAST:2018年发布,每月有超过10亿次查询。
  • Clustal Omega:2016年更新,速度快,准确率高。
    别信免费工具比对结果,就是坑。
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称雄三界

2026-05-12 17:08:16

序列数据库:

  1. GenBank(1982年,美国):全球最大的核酸序列数据库,包含超过1.3亿条序列。
  2. EMBL(1986年,欧洲):欧洲分子生物学实验室数据库,序列数量与GenBank相当。
  3. DDBJ(1986年,日本):日本DNA数据库,序列数量较少。
    序列比对工具:
  4. BLAST(1990年,美国):基于统计模型,快速比对短序列。
  5. Clustal Omega(2007年,全球):基于启发式算法,适用于长序列比对。
  6. MUSCLE(1998年,美国):快速比对长序列,比Clustal Omega更准确。
  7. MAFFT(1997年,日本):基于启发式算法,适用于长序列比对,比MUSCLE更准确。