序列数据库:
- GenBank:2023年1月,包含超过30亿条序列。
序列比对工具: - BLAST:2018年发布,每月有超过10亿次查询。
- Clustal Omega:2016年更新,速度快,准确率高。
别信免费工具比对结果,就是坑。
序列数据库:
- GenBank(1982年,美国):全球最大的核酸序列数据库,包含超过1.3亿条序列。
- EMBL(1986年,欧洲):欧洲分子生物学实验室数据库,序列数量与GenBank相当。
- DDBJ(1986年,日本):日本DNA数据库,序列数量较少。
序列比对工具: - BLAST(1990年,美国):基于统计模型,快速比对短序列。
- Clustal Omega(2007年,全球):基于启发式算法,适用于长序列比对。
- MUSCLE(1998年,美国):快速比对长序列,比Clustal Omega更准确。
- MAFFT(1997年,日本):基于启发式算法,适用于长序列比对,比MUSCLE更准确。